임상 데이터 플랫폼, 인디애나 대학교 암 센터 연구 간소화

인디애나 대학교 멜빈 앤 브렌 사이먼 종합 암 센터의 생체 시료 수집 및 바이오뱅킹 핵심 책임자인 Anna Maria V. Storniolo 박사와 그녀의 팀은 센터의 모든 생체 시료 샘플의 종합적 관리를 담당합니다.

핵심 연구에는 암 환자의 혈액, 조직 샘플 및 임상 데이터가 포함되어 있으며, 5,000명 이상의 여성으로부터 세계 유일의 정상 유방 조직의 생물학적 저장소인 코멘 조직 은행에 기증된 조직, 혈액 및 병력도 포함되어 있습니다.

문제

“상상할 수 있듯이, 이러한 샘플을 효율적으로 수집, 보관, 배포 및 카탈로그화하는 것은 복잡한 작업입니다.” Storniolo가 말했습니다. “핵심이 출시되었을 때 샘플은 여러 다른 데이터베이스에서 관리되었으며 각각을 구성하는 방법에 대한 표준 운영 절차가 없었습니다.

“이질적인 시스템을 관리하는 행정적 부담으로 인해 연구 질의를 완료하는 데 몇 주가 걸릴 수 있었고, 데이터 생성 작업은 종종 프로젝트 간에 중복되었습니다.” 그녀는 지적했습니다. “이 작업은 많은 검색이 수동으로 이루어졌기 때문에 이 작업을 지원하는 팀에게 엄청나게 시간이 많이 걸렸습니다.”

게놈 시대에 의료는 다양한 시점, 인구 및 개인에 걸쳐 많은 통찰력을 얻을 수 있습니다. 이를 최대한 활용하기 위해 암 센터는 정보에 액세스하는 과정을 단순화해야 합니다. 과학자들은 제한된 시간을 가진 해당 분야의 전문가입니다. 정확하고 신뢰할 수 있는 정보를 제공하는 사용자 친화적인 도구가 필요합니다.

“우리는 데이터를 신비화 해제하고 다양한 플랫폼에서 종합하여 연구를 주도하는 질문에 답해야 합니다.” Storniolo가 설명했습니다. “이를 위해서는 복잡한 데이터베이스에서 통신할 수 있는 도구가 필요하므로 연구자들은 제한된 IT 리소스에 의존하지 않습니다.”

제안

IU 암 센터는 데이터 “유니버스” 전반에 걸친 데이터 양과 구조화된 데이터와 구조화되지 않은 데이터 모두의 다양한 유형의 데이터와 관련된 복잡성을 처리할 수 있는 플랫폼이 필요했습니다. 임상 데이터 플랫폼은 모든 사용 가능한 데이터를 조화시키고 암 센터를 위한 공유 리소스를 만들어 생체 시료 데이터를 임상 및 유전 데이터와 하나의 접근 가능한 도구로 연결하겠다고 약속했습니다.

“이 플랫폼을 사용하면 팀은 특정 코호트에 대한 질문에 빠르게 답하고 연구팀과 더 잘 협업할 수 있을 것입니다.” Storniolo가 말했습니다. “환자의 프라이버시와 데이터 보안이 유지되고 파트너 간의 더 빠르고 쉬운 민주화가 가능하다는 확신은 엄청났습니다.”

도전에 맞서다

암 센터와 임상 데이터 플랫폼 공급업체는 바이오뱅크로서의 센터의 요구 사항과 바이오뱅크 및 데이터 사용자로서의 연구자의 요구 사항에 매우 구체적으로 맞는 데이터 시스템을 구축하기 위해 긴밀히 협력했습니다..

“프로젝트가 아직 구축되고 테스트 중이지만, 지금까지 본 가장 큰 영향 중 하나는 속도입니다.” Storniolo가 말했습니다. “과거에는 과학자가 나이, 암 생물학 세부 정보 및 치료 유형과 같은 특정 매개변수를 가진 특정 수의 환자를 살펴봐야 하는 경우, 기준에 맞는 샘플 수, 샘플 위치 및 요청한 연구자가 접근할 수 있는지 여부를 파악하는 데 며칠에서 일주일이 걸렸습니다.”

그녀는 이 플랫폼을 사용하면 몇 분 안에 이 작업을 마칠 수 있다고 덧붙였다.

결과

내년에 IU 암 센터는 더 많은 복잡한 연구 요청을 지원하고 수동 작업에 소요되는 시간과 중복된 연구 데이터 생성이 줄어들 것으로 기대합니다.

“저희 연구원들은 셀프 서비스 방식으로 실시간으로 샘플 가용성을 확인할 수 있을 것입니다.” Storniolo가 보고했습니다. “이를 통해 현재 이러한 검색을 수행할 수 있는 제한된 직원의 병목 현상으로 인해 현재보다 더 빠르게 프로젝트 실행 가능성을 결정하거나 새로운 프로젝트에 대한 아이디어를 생성할 수 있습니다.”

연말까지 직원들은 다음과 같은 결과를 기대합니다.

• 수동 작업에 소요되는 시간이 50% 감소하고, 중복되는 연구 데이터 생성이 줄어들어 전반적인 운영 비용이 감소했습니다.
• 요청 당 소요시간이 크게 단축되었습니다(몇 개월에서 몇 분으로).
• 연구 프로젝트 지원 건수가 50% 증가했습니다.

다른 사람들을 위한 조언

“첫 번째 단계는 연구원에게 무엇이 필요한지 묻고 업계의 변화에 ​​적응하고 발맞추려는 기술 공급업체를 찾는 것입니다.” Storniolo가 조언했습니다. “우리는 파이프라인을 따라오는 모든 것을 알지 못하고 과학에 대한 우리의 생각은 항상 변하기 때문에 진정한 협력자이며 사용자의 요구에 적응할 수 있는 개발자와 협력하는 것이 필수적입니다.

“기술적 요구 사항을 생각할 때는 지금 당장 필요한 것과 과학이 계속 변화함에 따라 미래에 발생할 수 있는 요구 사항을 모두 고려해야 합니다.” 그녀는 이렇게 덧붙였습니다.

그녀는 사용자의 요구 사항 외에도 효율성이 중요한 고려 사항이라고 덧붙였다.

“오늘날 과학 데이터의 복잡성과 깊이는 종종 많은 수동 작업을 초래합니다.” 그녀는 말했습니다. “기술로 효율성을 얻을 수 있는 곳을 이해하는 것이 중요합니다. 수동 작업 중 일부를 제거하여 연구자에게 가장 큰 가치를 제공할 수 있는 곳을 생각해야 합니다.

“전반적으로 기술을 받아들이는 것은 도전적인 것처럼 보일 수 있지만, 이를 하는 우리의 목표는 과학을 제한하는 것이 아니라 강화하는 것입니다.” 그녀는 결론지었습니다. “적절한 기술을 사용하면 팀은 데이터에 더 쉽게 접근할 수 있고 연구를 가속화하여 혁신과 돌파구를 마련할 수 있습니다.”

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Healthcare IT News는 HIMSS Media에서 발행하는 출판물입니다.